Modernizacja trwała dwa lata. Samorząd Mazowsza przeznaczył na ten cel ponad 8 mln zł.
W ramach projektu opracowano koncepcję i dokumentację do modernizacji oraz wykonano roboty budowlano-montażowe. Zakupiono także specjalistyczne wyposażenie, takie jak defibrylatory, laryngoskopy, kardiomonitory, pompy żywieniowe, a także niezbędne sprzęty: szafy, łóżka, wózki i wanny transportowe, elementy kuchni i łazienki dla pacjentów. Łączny koszt modernizacji oddziału neurologicznego wyniósł niemal 8,3 mln zł, z czego samorząd województwa pokrył koszty w wysokości 8 mln zł.
Szpital Kolejowy w Pruszkowie od 2017 roku funkcjonuje jako jednostka organizacyjna Mazowieckiego Centrum Rehabilitacji STOCER Sp. z o.o. w Konstancinie-Jeziornie. Jest jednym z trzech szpitali działających na terenie powiatu pruszkowskiego, jednak jedyną tego typu jednostką o tak szerokim i kompleksowym zakresie oferowanej opieki zdrowotnej. Dysponuje 9 oddziałami szpitalnymi, 14 przychodniami specjalistycznymi oraz 10 pracowniami diagnostycznymi.
